- Бухгалтерия
- Департамент государственных закупок и контрактов
- Испытательный центр
- Комитет по контролю за наркотиками
- Комитет по новой медицинской технике
- Лаборатория вакцин, сывороточных препаратов и микробиологических исследований
- Лаборатория контроля качества и стандартизации лекарственных средств
- Лаборатория контроля качества изделий медицинского назначения и медицинской техники
- Лаборатория фармако-токсикологических исследований
- Метрологической службы Министерства здравоохранения
- Орган по сертификации медицинской продукции
- Отдел административно-хозяйственных дел
- Отдел внедрения специальной цифровой маркировки
- Отдел информационных технологий
- Отдел кадров
- Отдел международных отношений
- Отдел менеджмента качеством
- Отдел развития государственной фармакопеи
- Отдел регистрации
- Отдел фармакологического контроля
- Отдел формирование референтных цен
- Полиграфический отдел
- Сектор комплаенса и финансового контроля
- Управление лицензирования фармацевтической деятельности
- Управление постмаркетингового надзора
- Фармакологический комитет
- Фармакопейный комитет
- Финансово экономический отдел
- Юридический отдел